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[分享] 预测CpG岛的在线软件

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Penelope512 发表于 2009-12-28 18:35:06 | 显示全部楼层 |阅读模式
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预测CpG岛的软件,很有用

CpG岛 search software.rar

4.57 KB, 下载次数: 586, 下载积分: 秀基因 -2 个

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参与人数 2秀基因 +7 秀蛋白 +1 收起 理由
bioaizhiying + 3 果断支持
jimsu + 4 + 1 谢谢相关资料

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jimsu 发表于 2009-12-28 19:40:30 | 显示全部楼层
很好。顶你
jimsu 发表于 2009-12-28 21:02:35 | 显示全部楼层
第二类:CpG岛序列分析软件。此类软件根据一定的规则对基因组DNA序列的CpG岛进行预测。CpG岛的准确预测是进行MSP和BS引物设计的基础。不过,在第一类软件中往往也包括了CpG岛的分析与预测功能。
软件:CpGPlot/CpGReport/Isochore
主页:http://www.ebi.ac.uk/emboss/cpgplot/
简介:由欧洲EBI网站提供的基因组DNA序列CpG岛分析软件,单凭EBI的名气,想必大家对其功能平添几分信任度吧?
文献:暂缺
推荐:★★★★★
软件:CpGProD
主页:http://pbil.univ-lyon1.fr/software/cpgprod_query.html
简介:CpGProD也是一款专门针对哺乳动物基因组DNA序列CpG岛进行分析的在线软件,其特点和功能类似于上述介绍的EBI网站的相关软件。
文献:暂缺
推荐:★★★★☆
软件:CpG Island Searcher
主页:http://www.cpgislands.com/http://cpgislands.usc.edu/
简介:基因组DNA序列CpG岛进行分析的在线软件,其特点和功能类似于上述介绍的EBI网站的相关软件。
文献:Takai D, Jones PA. The CpG island searcher: a new WWW resource. In Silico Biol. 2003;3(3):235-40 (PMID: 12954087)
推荐:★★★★☆

软件:CpG Prediction :http://www.ualberta.ca/~stothard/jaascript/cpg_islands.html

软件:CPG island 2:http://inn.weizmann.ac.il/EMBOSS/,工具很多,cpg岛工具cpgplot肯定有,自己慢慢找

点评

这些个网站帮我了不小的忙,非常感谢!  发表于 2011-7-7 11:00

评分

参与人数 2秀基因 +6 收起 理由
bioaizhiying + 3 相当给力哦,果断支持
whbaisy + 3 谢谢分享

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whbaisy 发表于 2009-12-28 21:17:24 | 显示全部楼层
支持一下版主
jimsu 发表于 2009-12-30 21:48:00 | 显示全部楼层
谢谢 对表观遗传学感兴趣的可以加我们的表观遗传学QQ群:92178764 Epigenetic Group
04505029 发表于 2010-3-25 15:19:17 | 显示全部楼层
很好,楼主辛苦了。呵呵
世外仙猪 发表于 2010-6-6 14:36:57 | 显示全部楼层
无限牛!顶!
haze 发表于 2010-6-8 11:54:06 | 显示全部楼层
顶下,
exin11 发表于 2010-9-1 19:48:52 | 显示全部楼层
xiexie
sigema9136 发表于 2010-9-9 09:19:10 | 显示全部楼层
谢谢
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